近年来，安徽财政围绕公立医院临床重点专科建设，打破“吃大锅饭”“撒胡椒面”的支持方式，精准支持打造高水平临床专科，提升全省整体医疗服务能力和疑难重症诊疗水平。
该省出台《安徽省省级临床重点专科建设项目管理办法（试行）》，建立临床重点专科申报、遴选、考核、评估机制，实行“一专科一策”给予资金支持，每个重点专科最高补助400万元。“十四五”以来，全省累计获批国家临床重点专科31个，获中央财政补助资金约1.55亿元；省财政累计投入1.75亿元，建成100个省级临床重点专科。
同时，该省着力打造重点专科发展样板。省财政每年安排3000万元专项资金，连续5年投入1.5亿元，支持省胸科医院心脏主动脉外科建设，努力提升长三角顶尖心血管疾病诊治水平。2023—2024年，省胸科医院累计完成心外科手术745台，其中四类手术占比超过90%，手术术式涵盖了几乎所有心脏外科手术，有效保障了省内主动脉疾病患者的及时救治。
为支持头部医院高峰学科建设，安徽省财政推动省政府出台关于推进高水平医院高质量发展的若干意见，统筹资金支持中科大附一院、安医大一附院对标打造全国一流医院。2025—2027年，省财政将持续投入1.8亿元，带动医院投入1.8亿元，支持12个优先发展的国家重点临床专科建设，力争通过3—5年的发展，集中力量打造一批全国一流水平的品牌专科。
