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用R语言及其相关生物信息学包(Seurat、ggplot2、patchwork、dplyr、Rfast2、hdf5r、viridis、glmGamPoi、SingleR、celldex和RColorBrewer)对10x Genomics空间转录组数据进行系统分析。首先构建Seurat对象并挂载空间信息,通过VlnPlot和SpatialFeaturePlot对空间转录本数(nCount_Spatial)进行可视化,评估数据质量。随后用SCTransform进行归一化处理,并通过PCA降维、邻域查找(di
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有一个很有意思的事情啊,就是索菲娅第一天上课的时候,魏尔斯特拉斯给了她一本书,然后告诉她一句话,“去读读阿贝尔”。魏尔斯特拉斯是阿贝尔的超级粉丝,他跟每一个学生都会说这句话,“去读读阿贝尔”,索菲娅当时可能也没怎么留意这句话。直到15年以后,索菲娅开始研究“数学水妖”问题,这是她一生中最重要的数学成就,她突然发现解决“数学水妖”问题的关键钥匙,就是她第一天上课学到的东西——阿贝尔函数。——贾君鹏科普连载系列《最伟大的女数学家》第2.24章
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